MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyorhinis HUB-1 chromosome

Total Repeats: 4339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014448	CTT	2	6	1258	1263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014448	T	6	6	1262	1267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014448	GTT	2	6	1269	1274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014448	T	6	6	1273	1278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014448	TAT	3	9	1304	1312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014448	T	6	6	1315	1320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014448	ATAAA	2	10	1332	1341	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014448	TAAT	2	8	1342	1349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014448	CAAA	6	24	6988	7011	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014448	A	29	29	7009	7037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014448	AAATA	2	10	7046	7055	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014448	TTA	2	6	7091	7096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014448	GTTG	2	8	7119	7126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014448	TAA	2	6	7164	7169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014448	CTT	2	6	7173	7178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014448	T	6	6	7183	7188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014448	A	10	10	7191	7200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014448	A	8	8	7215	7222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014448	TCT	2	6	7230	7235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014448	ATT	2	6	7241	7246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014448	AGT	2	6	7253	7258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014448	ATTA	2	8	7310	7317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014448	T	6	6	7345	7350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014448	ATTT	2	8	7400	7407	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014448	TAAA	2	8	7492	7499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014448	CAA	2	6	7501	7506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014448	AAAAT	2	10	7507	7516	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014448	A	6	6	7519	7524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014448	AGA	2	6	7529	7534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014448	AAC	2	6	7535	7540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014448	TCCAA	2	10	7544	7553	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_014448	ACAA	2	8	7554	7561	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014448	T	6	6	7583	7588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014448	CTT	2	6	7594	7599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014448	TAG	2	6	7603	7608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014448	ATAA	2	8	7609	7616	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014448	ATT	2	6	9134	9139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014448	T	6	6	9138	9143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014448	AAT	2	6	9144	9149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014448	A	20	20	9157	9176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014448	T	7	7	9190	9196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014448	CCA	2	6	9227	9232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_014448	TTG	2	6	9239	9244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014448	T	8	8	9245	9252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014448	CTT	2	6	9275	9280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014448	ATT	2	6	9340	9345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014448	TAC	2	6	9352	9357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014448	T	7	7	9371	9377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014448	T	6	6	9380	9385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014448	ATTT	2	8	9409	9416	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014448	CCT	2	6	15023	15028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_014448	A	7	7	15049	15055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014448	GAA	2	6	15064	15069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014448	T	7	7	15081	15087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014448	T	6	6	15122	15127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014448	AAT	2	6	17246	17251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014448	T	6	6	17258	17263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014448	T	7	7	17976	17982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014448	TAT	2	6	18004	18009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014448	A	6	6	18020	18025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014448	A	8	8	18033	18040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014448	A	7	7	18043	18049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014448	ATTTTT	2	12	18059	18070	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014448	A	6	6	18106	18111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014448	A	6	6	18115	18120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014448	A	17	17	18148	18164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014448	T	8	8	18178	18185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014448	AAAAC	2	10	18270	18279	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_014448	TTA	2	6	18284	18289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014448	T	6	6	18299	18304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014448	CGCT	2	8	18332	18339	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014448	CATG	2	8	18352	18359	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_014448	ACCTA	2	10	18410	18419	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_014448	TTAT	2	8	18470	18477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014448	ATG	2	6	18481	18486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014448	TTAG	2	8	18538	18545	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014448	GAT	2	6	18572	18577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014448	GCA	2	6	18645	18650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014448	TTC	2	6	18711	18716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014448	CTG	2	6	18727	18732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014448	GAA	2	6	18741	18746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014448	A	6	6	18745	18750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014448	TTA	2	6	18784	18789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014448	CAG	2	6	18813	18818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014448	ATT	2	6	18854	18859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014448	T	6	6	18880	18885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014448	GAA	2	6	19004	19009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014448	TA	3	6	19038	19043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014448	GAT	2	6	19112	19117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014448	TGG	2	6	19125	19130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014448	AAT	2	6	19131	19136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014448	AGT	2	6	19174	19179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014448	TCT	2	6	19285	19290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014448	GTC	2	6	19345	19350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014448	TCGTG	2	10	19354	19363	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014448	TTAAG	2	10	19418	19427	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014448	AGG	2	6	19455	19460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014448	GAC	2	6	19469	19474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014448	ATC	2	6	19480	19485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014448	AC	3	6	19507	19512	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_014448	A	6	6	19567	19572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014448	GCTAC	2	10	19643	19652	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_014448	AC	3	6	19677	19682	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014448	TGA	2	6	19759	19764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014448	CCT	2	6	19816	19821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_014448	TAT	2	6	19953	19958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014448	T	6	6	19969	19974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014448	TAAAT	2	10	19993	20002	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014448	AAT	2	6	20054	20059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014448	TAAG	2	8	20092	20099	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014448	TGG	2	6	20106	20111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014448	TGA	2	6	20239	20244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014448	TAG	2	6	20289	20294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014448	GAAAA	2	10	20301	20310	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014448	AAT	2	6	20313	20318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014448	AGT	2	6	20328	20333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014448	GCGA	2	8	20335	20342	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014448	TAG	2	6	20412	20417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014448	AAG	2	6	20418	20423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014448	ACC	2	6	20534	20539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_014448	AGT	2	6	20650	20655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014448	A	6	6	20733	20738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014448	GGA	2	6	20849	20854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014448	GTA	2	6	20862	20867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014448	GGC	2	6	21004	21009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014448	AAC	2	6	21104	21109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014448	AAC	2	6	21170	21175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014448	AGC	2	6	21193	21198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014448	AAT	2	6	21248	21253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014448	TGG	2	6	21345	21350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014448	ACA	2	6	21494	21499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014448	ATG	2	6	21528	21533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014448	CAA	2	6	21582	21587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014448	TA	3	6	21594	21599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014448	T	6	6	21705	21710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014448	GAAC	2	8	21726	21733	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014448	AC	3	6	21732	21737	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014448	GCGA	2	8	21761	21768	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014448	AAG	2	6	21815	21820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014448	G	6	6	21853	21858	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014448	CT	3	6	21881	21886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_014448	ACG	2	6	21900	21905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_014448	CGG	2	6	21990	21995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_014448	ATT	2	6	22041	22046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014448	ACC	2	6	22261	22266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_014448	GTG	2	6	22320	22325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014448	CCT	2	6	22348	22353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_014448	CGG	2	6	22483	22488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_014448	CTGGAG	2	12	22609	22620	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_014448	CGT	2	6	22679	22684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_014448	TGA	2	6	22725	22730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014448	GCT	2	6	22733	22738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_014448	AAGTGT	2	12	22916	22927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_014448	TTG	2	6	23067	23072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014448	TTG	2	6	23089	23094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_014448	TAA	2	6	23096	23101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_014448	TAA	2	6	23119	23124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014448	A	7	7	23128	23134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_014448	TAA	2	6	24133	24138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_014448	A	7	7	24145	24151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_014448	TTG	2	6	25665	25670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_014448	TA	3	6	25698	25703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_014448	T	6	6	31691	31696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_014448	ATTAA	2	10	32621	32630	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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242	NC_014448	TTCTT	2	10	48450	48459	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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257	NC_014448	T	7	7	48812	48818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_014448	T	6	6	49563	49568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_014448	CAT	2	6	49603	49608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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290	NC_014448	AATA	2	8	49862	49869	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_014448	T	6	6	49886	49891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_014448	TCA	2	6	49895	49900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_014448	T	6	6	49931	49936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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